4 projects
Working on Engineered bacteria CAD design on its genome from scratch. Writing scientific computing software for Tianhe & Sunway TaihuLight supercomputer.
Public Function xieguigang() As String
Return "Hello world!"
End Function
2017至今 代谢组学研究领域小分子代谢物快速鉴定程序包biodeepMSMS作者,该程序包实现了基于二级质谱数据矩阵的余弦相似度计算,应用于LC-MS以及GC-MS原始数据分析之中的小分子代谢物的快速鉴定。帕诺米克biodeepMSMS程序包目前为国内行业内性能最佳的小分子代谢物物质鉴定分析系统。
2017至今 帕诺米克BioDeep代谢组学云分析平台开发工程师,该平台为用户提供了代谢组学原始数据的小分子代谢物快速鉴定,以及多元统计分析等在线数据处理功能。
2018至今 建立和更新苏州帕诺米克非靶向代谢组学标准品统一数据库biodeepDB,该数据库产品对目前主流的公共代谢物信息数据库中的物质注释信息进行统一编号标准化处理,为苏州帕诺米克公司的非靶向代谢组学数据分析业务之中的小分子代谢物鉴定提供统一以及可靠的物质注释信息源。
2018年 苏州帕诺米克公司脉诺康心脑血管健康管理产品开发工程师,主要负责实现脉诺康心脑血管健康管理产品的自动化数据处理后台以及在线数据管理系统的构建。
2019年 建立苏州帕诺米克公司脉诺康心脑血管疾病QE非靶向代谢组学数据机器学习分析方法,该机器学习分析方法可以比较准确的基于受检者血液样本的QE非靶向数据判断出受检者是否患有心脑血管疾病以及疾病的严重程度。
2019年 负责开发苏州帕诺米克公司QE全靶内标半定量分析程序包biodeepProfiler。该程序包基于NIST标准血清以及样本中的内标物质建立代谢物的半定量标准曲线,对QE平台的LCMS非靶向原始数据进行半定量计算分析,本分析方法极大的提升了对代谢组学原始数据的质控以及分析应用。
目前任职于国内最大的代谢组学科研服务商苏州帕诺米克生物,从事公司的主营业务的数据分析产品的研发工作。 并且同时也承担着进行代谢组学消费者应用方面的前瞻性的探索工作。
2014至今 系统生物学领域开源软件GCModeller(https://gcmodeller.org/)CAD软件平台的首席科学家以及首席开发工程师,致力于代谢组学数据分析在虚拟细胞人工生命系统,合成生物学等生物信息学先进技术领域内的商业化应用的探索。GCModeller软件于2016年开源;2017年GCModeller软件成为国际BIOM(http://biom-format.org/)生物观测数据矩阵数据存储格式标准成员软件之一,致力于推广生物观测数据矩阵数据存储格式在微生物组,宏基因组,代谢组,等其他组学分析中的应用。其他成员软件还包括行业内知名的QIIME,Mothur,欧洲分子生物学实验室(EMBL)的宏基因组学分析软件等。